金稅三期系統上線之后，在進行申報增值稅前，我們首先要明確的是，企業有兩種類別：①小規模納稅人②一般納稅人企業。(以深圳市為例)
1、小規模納稅人企業的納稅申報，該類型的企業增值稅為季度申報，申報日期為：季度終了，次季度初15號前(如有假期則會延期)。
登錄國稅官方網站：①實名認證方式登錄;②輸入納稅識別號及密碼進行登錄。登錄進入國稅官方頁面之后，點擊增值稅，“我要申報”按鈕，按照步驟，錄入上季度開票金額(包含自開、代開)，點擊下一步，逐步生成報表，保存并提交申報表。又有退款生成，則點擊稅款繳納，完成申報。
2、一般納稅人
企業的增值稅申報，該類型的企業為月度申報，申報時間為月度終了次月15號前(如有法定節假日，則會延期)。
申報的流程：①首先在金稅盤或稅控盤開票軟件，進行抄報稅或上報匯總，打印增值稅專用(或普通)發票匯總表及明細表，記住，一要選擇累計匯總打印。②在網上電子申報系統，銷項及進項數據，點擊自動生成報表，并且保存。發送申報表，并獲取數據反饋。申報成功后，又有稅金，則點擊稅款繳納，進行稅款扣除。③返回到金稅盤或稅控盤開票軟件，進行遠程清卡或反寫，操作成功后退出軟件，若能順利重新進入系統，則申報完成。
當然，在完成了增值稅申報后，不要忘了增值稅附征的申報，以及個人所得稅，還有企業所得稅。
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